В корнях зопника клубненосносного обнаружены алкалоиды, эфирные масла, сапониты, крахмал, каротин, дубильные элементы, гликозиды, минеральные соли, флавоноиды, иридоиды. Применяют зопник как вяжущее и желчегонное средство, кровоостанавливающее, противосудорожное, заживляющее, понижающее температуру и снимающее озноб, противовоспалительное лекарство.Кроме этого, употребление отваров и настоев зопника показано при появлении попиломы в мочевом пузыре и цистите. Помогает растение и при заболеваниях желудочно-кишечного тракта, таких как язва и гастрит.